O Pix Cobrança substitui o boleto bancário?

Sim, com vantagens. Ele permite emitir cobranças com vencimento futuro, juros, multas e descontos. A diferença é que a compensação é instantânea após o pagamento, eliminando o prazo de até 3 dias úteis do boleto tradicional. (Atualmente, o iFood Pago não possui esta funcionalidade, mas em breve teremos!).